Drugog dana pravoslavnog Vasrksa, na današnji dan, 12. aprila 1999. godine, avioni NATO pakta su bombardovali putnički voz u Grdeličkoj klisuri sa dve rakete.
Voz je pogođen u trenutku kada je prelazio preko železničkog mosta na Južnoj Moravi u Grdeličkoj klisuri.
Voz je krenuo sa 15 minuta zakašnjenja iz Niša prema Leskovcu. Ispaljena su četiri projektila iz NATO aviona, dva su pala na obližnji drumski most preko Južne Morave, a dva projektila su pogodila voz.
Prvi projektil, ispaljen tačno u 11:39 časova, je odvojio lokomotivu i prvi vagon od ostatka voza, dok je drugi projektil spržio treći vagon, a četvrti ostao zalepljen za šine.
Izginulo je i bilo povređeno mnogo putnika. Tačan broj, kako poginulih, tako i ranjenih, do današnjeg dana nije utvrđen, jer su mnoga tela potpuno izgorela u plamenu.
Rezultati istrage potvrđuju da je broj putnika u vozu bio veći od 50, a među poginulima je bilo trudnica i dece.